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绵阳市疾病预防控制中心致病菌全基因组二代测序和宏基因组测序服务竞争性谈判采购公告

发布日期:2024-11-21 16:14文章来源: 绵阳市疾病预防控制中心 浏览次数:
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为持续做好疾病监测和应对工作,加强微生物样本一代测序、致病菌全基因组二代测序及样本宏基因组规范性,需采购致病菌全基因组二代测序和宏基因组测序服务,特邀请符合本次要求的供应商参加本项目谈判。

一、项目限价:

项目限价不超过8.6万元;(其中,预计开展宏基因组测序样本/菌株80份,每份单价不超过400元;预计开展致病菌全基因组二代测序服务样本/菌株300份,每份测序单价不超过180元。)

二、服务内容及技术要求:

详见附件(本项目所投产品需满足对应所有服务要求)

三、投标需提供材料

1.具有独立承担民事责任的能力;

2.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度,有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录(可提供承诺书)

3.具有履行合同所必需的设备和专业技术能力(提供承诺书);

4.参加本次采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法违规记录;(提供承诺书)

5.本次招标不接受联合体投标,且不允许分包或转包。

6.法律、行政法规规定的其他条件。

7.报价单。(本项目采取竞争性谈判方式,投标资料中需递交报价单,现场再行二次报价。满足相关资质及技术要求的最低二次报价供应商作为本项目的成交供应商)

报价单

序号

服务内容

数量

单价

总价

1

宏基因组测序

80

 

 

2

全基因组二代测序

300

 

 

合计

8.服务技术参数响应情况。

报名供应商如提供虚假承诺或证明,一经发现,将取消其投标资格或中标资格。

四、商务要求

1.供货周期及要求:合同签订后服务期1年。

2.履约、验收要求与标准:参照政府采购相关法律法规以及《绵阳市财政局关于进一步做好政府采购项目履约验收工作的通知》(绵财采〔2021〕15号)的要求、成交供应商的响应文件及承诺以及合同约定标准进行验收。

3.款项支付方式:测序服务全部完成后以最终实际完成测序样本数量进行结算,若某份样本未获得合格数据,则该份样本不计费结算,服务期内服务总费用不超过预算金额,采购人于验收合格达到付款条件之日起30天内一次性支付实际应付服务费用。

4.本项目履约保证金为合同金额的5%,签订合同前,成交供应商需向采购人缴纳该笔履约保证金。履约完成供应商提出退还申请及提交相关资料后,采购人于30日内一次性无息全额返还该笔履约保证金。

五、报名材料递交时间

请各潜在供应商于2024年11月29日下午5时前将投标需提供的材料制作成纸质文件(一式三份,正本一份,副本两份)加盖公章,密封完好后于封面加盖公章,报名材料封面需备注供应商联系人及联系方式,递交到绵阳市疾病预防控制中心业务楼616办公室(绵阳市高新区绵兴东路50号)。

六、项目咨询联系人:陈老师 13890173709

资料递交联系人:苏老师 15881660111

绵阳市疾病预防控制中心

2024年11月21日


附件

致病菌全基因组二代测序和宏基因组测序服务项目技术要求

一、项目概述

为持续做好疾病监测和应对工作,加强微生物所样本一代测序、致病菌全基因组二代测序及样本宏基因组的便利性和规范性,提高测序经费的使用效益,故需统一采购二代测序服务以及宏基因组测序服务。

二、服务要求

(一)宏基因组测序

参数性质

序号

技术参数与性能指标

 

1

由于不能事先确定样本总数,以最终实际完成测序样本数量进行结算,预计完成80份样本的宏基因组测序每份样本/菌株测序价格不超400,以实际测序份数进行结算

 

2

宏基因组和样本接收:采购人提供原始样品,供应商配备专人负责样品的收集及运输,根据采购人需求实时收取样品,样品均需采用干冰进行运输,保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。

 

3

宏基因组和测序平台和策略:均利用二代测序平台,能完成双端PE150测序及以上测序,为确保测序数据的稳定性,供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。

 

4

宏基因组测序质量:碱基质量均达到Q3099.9%≥85%;(提供同类项目报告复印件,报告内容包括碱基质量Q30,并加盖供应商鲜章)

 

5

宏基因组测序数据统计与质控:均需进行原始序列统计,质控后序列统计,去宿主后序列统计,每份样品数据产出统计。

 

6

宏基因组交付数据:均需包括原始数据(rawdata,数据格式为fastq),质控后数据(cleandata,数据格式为fastq)和拼接后数据(数据格式为fasta)。

 

7

宏基因组宿主去除:均需将质控后数据(cleandata)与宿主基因组比对去除宿主的序列信息,提供去宿主序列信息后的有效数据。

 

8

宏基因组质控要求:每批样品收到后应立即开始DNA提取、质量检测等相应工作,使用电泳方法进行核酸样品完整性检测,使用Qubit进行样品浓度检测;DNA提取失败的样品,供应商不收取费用;样品DNA质量检测结果,浓度或总量满足建库条件,无严重RNA污染、无明显降解的样品,均为合格样品,非特殊情况,不得要求重新送样;上机测序前,对构建好的文库进行质量检测。(提供同类项目报告复印件,报告内容包括样品浓度检测报告和文库质量检测报告,并加盖供应商鲜章)

 

9

供应商提供核酸提取、文库制备、测序、数据处理的全流程服务。

 

10

1)保密要求:供应商应遵守国家法律法规,高度重视安全保密工作,供应商需提供承诺函(提供承诺函原件加盖供应商公章,格式自拟),承诺函内容应包含下述内容:不透露采购人及采购人系统中的数据信息;不得将样本及与样本有关信息转交于第三方及境外组织等。

2)数据的交付与保存:供应商成交后,需在接收到样本30个工作日内完成该批次所有样本检测与交付。提供每份样本收费明细,以此作为付款凭证。提供3个月样本与核酸保存服务,根据采购人需求,在协商周期内返还剩余样本及核酸;下机数据同时采用移动硬盘和网络下载的方式进行交付,网络下载方式数据下载期限不低于30天;测序下机后的原始数据供应商需保存三年。

3)项目验收

a.出具专业报告,样本浓度和文库浓度检测报告;下机原始数据及碱基评估报告;结果分析报告。

b.数据量要求

宏基因组测序,原始数据量(碱基数)≥6G,单个样本数据量(reads数)≥20M,碱基数据质量值Q30比例≥85%

对符合建库要求的样品,如测序失败,或测序数据量未达标,供应商需提供加测或者重测。对qPCR已判定为阳性的样本,如测序后未获得相应序列信息,亦视为测序失败。

4)技术指导:供应商应根据采购人要求,到采购人指定地点进行技术支持。

5运输:供应商负责样本运输,运输工具需具备冷链运输资质;运输过程中造成的损失、污染相关等问题,后果均由供应商承担。运输费用由供应商承担。

(二)致病菌全基因组二代测序服务

参数性质

序号

技术参数与性能指标

 

1

由于不能事先确定样本总数,以最终实际完成测序样本数量进行结算,至少需完成300份样本/菌株的测序,每份样本/菌株测序价格不超180元,以实际测序份数进行结算

 

2

样品接收:采购人提供菌高致病性菌株提供灭活菌株或核酸,供应商配备专人负责菌株/样品的收集及运输,根据采购人需求实时收取样品,菌株/样品需采用干冰进行运输,保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。

 

3

检测设备技术:供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序,能完成双端150bp及以上测序,为确保测序数据的稳定性,供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。 

 

4

数据要求:

PE150(双端测序,单向读长150bp)及以上测序。交付数据包括原始数据(rawdata)和拼接后数据(cleandata),原始数据格式为fastq,原始数据量(碱基数)≥1.5G,Q20高质量数据量(Clean data)≥1G,碱基数据质量值Q30比例≥85%,单碱基错误率低于十万分之一。拼接后数据格式为fasta。拼接后数据Scaffold数量<100个,Contig数量<200个。覆盖度要求碱基类型分布均匀,无GC分离;基因组10×覆盖度≥95%,基因区覆盖度≥98%,平均覆盖深度≥100×。

 

5

质控要求:

每批样品收到后应立即开始核酸提取、质量检测等相应工作,进行样品浓度检测和核酸样品完整性检测,核酸样品自收到之日起,于3日内提供当批样品质量检测报告(份数按采购人要求提供)。核酸样品质量检测结果:浓度不低于5ng/ul、总量不低于100ng,无严重RNA污染、无明显降解的样品,均为合格样品,非特殊情况,不得要求重新送样。核酸提取失败的灭活菌株样品,供应商需加测或者重测。

 

6

质控要求:文库长度250-350bp,对构建好的文库进行质量和产量的检测。

 

7

每批样品自质量检测合格采购人回复之日起,10个工作日内交付数据。结果(包含原始数据、拼接后数据)遵照生物安全和信息保密相关规定按采购人要求发往指定服务地点。使用方有权要求供应商提供本服务检测过程中的任何相关数据。

如遇样品质量检测合格,测序污染、失败等情况,供应商需立即启动加测,并于20日内交付全部加测样品的数据,如超过20日,则该批次样品不另外收取费用。

 

8

其他服务要求

1)供应商需按照《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》相关要求履行服务,保证信息安全,服务商须在投标文件中提供保密承诺函原件加盖供应商公章(格式自拟),承诺函内容应包含下述内容:不可将样本及与样本有关信息透露给第三方及境外组织,保证生物安全。样品检测过程中造成的损失、污染、生物危害相关等问题,后果均由服务商承担。

2)供应商提供的实验室需提供无任何外资、合资成份及外国员工,并保证今后不接受任何外资、合资加入。以上情况后果均由服务商承担。

3)供应商根据服务方需求,提供现场技术服务。

4)运输:服务商负责样本运输,运输工具必须具备冷链运输的资质;运输过程中造成的损失、污染相关等问题,后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。(提供承诺函原件加盖供应商公章,格式自拟)。

5)服务地点:为方便样本运输,供应商检测地点应为国内大中城市

三、知识产权要求:

(1)供应商应保证在本项目使用的任何产品和服务(包括部分使用)时,不会产生因第三方提出侵犯其专利权、商标权或其它知识产权而引起的法律和经济纠纷,如因专利权、商标权或其它知识产权而引起法律和经济纠纷,由供应商承担所有相关责任。

(2)本项目的知识成果及知识产权归采购人所有。

(3)供应商如欲在项目实施过程中采用自有知识成果,需在投标文件中声明,并提供相关知识产权证明文件。使用该知识成果后,供应商需提供开发接口和开发手册等技术文档,并提供无限期技术支持,采购人享有永久使用权(含采购人委托第三方在该项目后续开发的使用权)。

(4)如采用供应商所不拥有的知识产权,则在报价中必须包括合法获取该知识产权的相关费用。

(5)项目结束时项目执行单位应提交项目执行的所有文档(包括文字资料和电子文件)。项目执行单位未经采购人许可,不得在本项目以外使用。

四、其他要求

1.供应商针对本项目提供服务方案,包括:①人员配备,②实验操作规范性,③仪器运维,④应对突发状况处理方案。

2.供应商应提供2021年1月1日以来一个以上(含一个)同类服务合同。